Gözlərin rəngi qüzehi qişanın piqmentindən asılıdır, hansı ki, "melanin" adlanır. Melaninin miqdarı gözlərin rəngini müəyyən edir. Böyük miqdarda bu piqment tünd gözləri (qara, qonur və açıq-qonur) yaradır, və daha kiçik miqdar açıqəarı formalaşdırır (yaşılları və ya maviləri).

Gözlərin qırmızı rəngi yalnız albinoslarda rast gəlinir. O melaninin qüzehi qişasında yoxluqla bağlıdır, buna görə qüzehi qişanın damarlarında qanla təyin edilir.

Melaninin miqdarı irsiliklə təyin edilir. Dünyada daha çox qaragöz insanlar var, nə qədər açıq rəngli gözlərlə insanlar, və səbəb böyük miqdarda melaninlə bağlı əlamətlərin genetik hökmranlığında ibarət olur. Buna görə, əgər bir valideyndə ailədə tünd gözlər, və başqada — açıqlar, onların uşaqları, ehtimal ki, tünd gözlərə malik olacaqlar.

Gözlərin rəngi həyat ərzində dəyişə bilər. Bəzən tezliklə doğuluşdan sonra gözlərin rəngi aşıq tündə dəyişir — bu bəzən avropeoidlərdə rast gəlinir, və qüzehi qişada melaninin yığımıyla bağlıdır. Gözün yaşlı insanlarında bəzən solurlar ki, qatın mezodermal şəffaflığının müəyyən itkisiylə bağlıdır. Bundan başqa gözlərin rəngi dəyişə bilər və bəzi xəstəliklərlə əlaqədar.